抗體測(cè)序服務(wù)
單克隆抗體分子在藥物研發(fā)、診斷試劑開發(fā)中扮演了關(guān)鍵的角色??贵w分子的一級(jí)結(jié)構(gòu),特別是其CDR區(qū)域的氨基酸序列是發(fā)揮其生物學(xué)功能的核心,對(duì)其完整序列準(zhǔn)確快速的分析具有十分重要的意義??返律锊捎米钕冗M(jìn)的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀和強(qiáng)大的抗體測(cè)序數(shù)據(jù)處理軟件PEAKS AB Software,結(jié)合基因測(cè)序和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫,建立了全新一代抗體測(cè)序平臺(tái),實(shí)現(xiàn)對(duì)抗體一級(jí)結(jié)構(gòu)快速準(zhǔn)確的分析從而保證每一個(gè)抗體測(cè)序的準(zhǔn)確性。我們的平臺(tái)適用于不同亞型抗體,如IgA,IgE,IgG和IgM,以及不同形式的抗體,如熒光偶聯(lián)抗體,固定化抗體,不同物種的抗體的序列分析。
項(xiàng)目特征:
*僅需200ug抗體即可設(shè)計(jì)與完成LC-MS/MS 分析
*基于蛋白數(shù)據(jù)庫的de novo蛋白測(cè)序技術(shù)
*適用于所有物種抗體和不同抗體亞型
*直接定量轉(zhuǎn)錄后修飾和變異序列
*14天內(nèi)出結(jié)果(包含節(jié)假日)
服務(wù)優(yōu)勢(shì):
---抗體測(cè)序服務(wù)保證100%準(zhǔn)確
seline;">我們的測(cè)序服務(wù)執(zhí)行嚴(yán)格的質(zhì)量控制,采用寬進(jìn)窄出的原則,在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時(shí)實(shí)現(xiàn)了抗體序列的準(zhǔn)確鑒定。目前我們實(shí)驗(yàn)室使用的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀,相比于上一代Orbitrap Elite質(zhì)譜儀,Lumos在提高了一級(jí)二級(jí)質(zhì)譜掃描速度的同時(shí)保證肽段分子量的準(zhǔn)確性。同時(shí)結(jié)合我們行業(yè)標(biāo)桿性邏輯算法和強(qiáng)大的處理能力(基于PEAKS軟件分析),我們的抗體測(cè)序平臺(tái)將傳統(tǒng)技術(shù)很難區(qū)分分子量接近的氨基酸變得更加容易和精確,如實(shí)現(xiàn)分子量差異在0.03Da的谷氨酰胺和賴氨酸差別分析。
---抗體測(cè)序服務(wù)保證100%序列覆蓋
卡梅德生物針對(duì)不同的項(xiàng)目需求,會(huì)采用多達(dá)8種不同的蛋白酶對(duì)目標(biāo)抗體進(jìn)行消化酶切,利用PEAKS軟件自動(dòng)實(shí)現(xiàn)不同輕重鏈酶切肽段之間100%全序列拼接。對(duì)于抗體互補(bǔ)決定區(qū)域(CDR區(qū)域),至少生成含有單個(gè)位點(diǎn)的肽段序列10次,通過高覆蓋率,以保證后續(xù)抗體序列拼接準(zhǔn)確。
---強(qiáng)大的修飾分析能力
我們的抗體測(cè)序平臺(tái)能夠高效地區(qū)分同源氨基酸的不同變異體,通過二級(jí)碎裂片段的特征峰即可實(shí)現(xiàn)亮氨酸和異亮氨酸的準(zhǔn)確判定。對(duì)于轉(zhuǎn)錄后修飾的氨基酸分子,我們的系統(tǒng)也能高效區(qū)分。
---適用于熒光標(biāo)記單抗、IgMs、及其他非傳統(tǒng)抗體進(jìn)行測(cè)序
我們的抗體測(cè)序技術(shù)同樣能夠高效地完成小基團(tuán),如FITC、Biotin、Alexa等標(biāo)記抗體的測(cè)序工作,在增加抗體樣品量的情況下,我們也能完成類似GST等大蛋白基團(tuán)標(biāo)記的抗體測(cè)序工作。我們的技術(shù)適用于任何類型的抗體測(cè)序工作,目前我們已經(jīng)成功測(cè)序來自小鼠,兔子,羊駝,倉鼠和羊的抗體。在實(shí)際操作中,IGM的測(cè)序方法類似IgG,只是前者需要更多的蛋白樣品。
---嚴(yán)謹(jǐn)?shù)男蛄蓄A(yù)測(cè)和嚴(yán)格的序列驗(yàn)證
對(duì)于每一個(gè)抗體測(cè)序項(xiàng)目,我們都會(huì)給出具體的實(shí)驗(yàn)方案。首先,我們會(huì)先對(duì)項(xiàng)目抗體進(jìn)行序列預(yù)測(cè)。如客戶直接提供雜交瘤,我們也可以先進(jìn)行抗體測(cè)序后,再結(jié)合mRNA測(cè)序信息,以確??贵w單個(gè)氨基酸測(cè)序的準(zhǔn)確性。同時(shí),我們還會(huì)建立以測(cè)定序列為基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)庫,采用序列確認(rèn)的模式對(duì)采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行二次比對(duì)分析,以確保交付的產(chǎn)品完全無誤。