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巨大的DNA序列數(shù)據(jù)怎么辦?竟然有這工具

   日期:2018-03-08     瀏覽:309    
核心提示:發(fā)布日期:2018-03-07   電子產(chǎn)品不斷的更新迭代,生物信息學(xué)也絲毫不落后。日前Dotm

發(fā)布日期:2018-03-07

 

  電子產(chǎn)品不斷的更新迭代,生物信息學(xué)也絲毫不落后。日前Dotmatics推出了新一代Vortex產(chǎn)品(Vortex for Bioinformatics)。據(jù)公司報道該系列產(chǎn)品具備全新的生物信息學(xué)相關(guān)功能,能夠為生物制品研發(fā)提供針對性的幫助。

  Vortex是Dotmatics公司研發(fā)的一款支持?jǐn)?shù)據(jù)分析和可視化的軟件。此軟件具備數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計及繪圖功能,可用于理解和剖析任意大小和復(fù)雜度的數(shù)據(jù)。用此軟件,生物學(xué)家和相關(guān)領(lǐng)域研究人員可在不借助高度專業(yè)化的生物信息學(xué)技能下,實現(xiàn)一系列生物信息學(xué)研究,包括實驗數(shù)據(jù)的管理、分析及可視化。

  “在現(xiàn)如今的科研體系中,生物信息學(xué)的專業(yè)知識相對匱乏,其價格也十分昂貴。然而,并不是每一項生物研究都需要這方面的專業(yè)知識”,Dotmatics生物感應(yīng)器市場經(jīng)理Andrew LeBeau博士告訴我們,“新一代Vortex產(chǎn)品在性能上有所強(qiáng)化,是針對生物學(xué)家和相關(guān)研究人員量身定制的商用級科學(xué)信息管理工具,能夠?qū)ι镏破费邪l(fā)過程中獲得的相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行針對性的處理。其最終帶來的裨益,是為生物學(xué)家的研究鋪平道路,并且讓生物信息學(xué)研究人員能夠?qū)⑵溲芯恐攸c集中于高度專業(yè)化數(shù)據(jù)分析,以及開發(fā)出對科研領(lǐng)域有價值的算法。”

  “Vortex for Bioinformatics產(chǎn)品為綜合領(lǐng)域內(nèi)的生物研究提供了琳瑯滿目的輔助性工具,使得研究人員有能力對不同來源的高通量數(shù)據(jù)進(jìn)行及時的處理、分析和可視化,這大大加快了其研究進(jìn)展”,Dotmatics首席軟件架構(gòu)師Tom Oldfield博士說道,“此外,針對那些有望解決醫(yī)護(hù)、農(nóng)業(yè)及其他產(chǎn)業(yè)重大挑戰(zhàn)的新型單克隆抗體、其他衍生型抗體或者相關(guān)類型的抗體分子,最新版本的Vortex也能夠在其研發(fā)流程中發(fā)揮顯著的支持作用。”

  新一代Vortex(Vortex for Bioinformatics)

  Vortex for Bioinformatics是一款針對生物信息研發(fā)工作提供分析和可視化功能的工具,可用于單純的生物學(xué)研究,也可與現(xiàn)有的、具備化學(xué)信息學(xué)分析性能的Vortex聯(lián)合使用。這項工具包含能夠?qū)Ω黝惒煌纳飳W(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和可視化的方案,尤其是那些通量巨大的序列數(shù)據(jù)(如數(shù)百萬的DNA、RNA、肽或蛋白質(zhì)序列等)。Vortexfor Bioinformatics進(jìn)一步擴(kuò)充并完善了包括研究、研究記錄和生物注冊在內(nèi)的Dotmatics全套件。

  可能具備的幾個功能包括:

  可對相關(guān)序列進(jìn)行手動編輯,從而實現(xiàn)突變的設(shè)計和補(bǔ)充、序列的插入和刪除,進(jìn)一步強(qiáng)化Vortex在突變型抗體設(shè)計和其他序列實體等方面的技能;

  可通過手動和相關(guān)算法實現(xiàn)多項性、重疊性序列注釋的添加,進(jìn)一步強(qiáng)化常規(guī)的序列注釋功能;

  可對相關(guān)序列進(jìn)行搜索,方便使用者對重要殘基和序列基序的位置進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的定位;

  可對相關(guān)序列進(jìn)行標(biāo)號統(tǒng)計,加快抗體研發(fā)工作的進(jìn)展;

  可對互補(bǔ)決定區(qū)(CDR)進(jìn)行配對、注釋和高亮,從而使相關(guān)抗體功能的分析工作更加快捷。

  Dotmatics公司

  Dotmatics公司成立于2005年,總部位于英國的畢曉普斯托福德,是一家專注于數(shù)據(jù)管理、分析及可視化的科學(xué)信息學(xué)企業(yè)。目前,全世界排名前20的制藥企業(yè)中有一半已與Dotmatics公司形成良好的合作關(guān)系。

  來源:

Dotmatics Launches New Release of Vortex

Dotmatics官網(wǎng)

 

來源:藥渡

 
 
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